Project description
Le lauréat 2018 est le Dr. Paul McLellan, interne en gastroentérologie en 7ème semestre à l'hôpital Saint-Antoine à Paris, pour son projet de recherche intitulé "Utilisation de la protéine bactérienne MAM comme biomarqueur de l'inflammation intestinale au cours de la maladie de Crohn", au sein de l’unité INSERM «Microorganismes et physiopathologie intestinale » dirigée par le Pr Philippe Seksik.
Depuis le début de son internat, le Dr. Paul McLellan souhaite participer à l’approfondissement des connaissances concernant le microbiote, les maladies inflammatoires du tube digestif et leurs liens, et travailler avec l’équipe de gastro-entérologie de l’hôpital St Antoine, pionnière en la matière.
Notre équipe explore depuis quelques années le microbiote de patients atteints de Maladie de Crohn (MC) ce qui lui a permis de mettre en évidence des anomalies de cet écosystème. Plus précisément, nous avons observé de façon répétée la perte d’une bactérie majeure de cet écosystème appelée Faecalibacterium prausnitzii (F. prau). La diminution de cette bactérie au cours de la MC n’est pas seulement le témoin de la maladie mais apparait également comme un facteur aggravant. En effet, notre équipe a montré que cette bactérie pouvait agir comme un anti-inflammatoire. La perte de cette bactérie anti-inflammatoire pourrait donc participer au maintien de l’inflammation au cours de la MC. Cette bactérie étant très difficile à cultiver car très sensible à l’oxygène, on ne peut pas imaginer pour l’instant la produire en grande quantité afin de l’apporter en tant que ‘médicament’. Nous nous sommes donc intéressés aux composés produits par cette bactérie et responsables de cet effet anti-inflammatoire. Nous avons récemment identifié une protéine de F. prau (ZP05614546.1) capable de bloquer les voies de l’inflammation dans l’épithélium de l’intestin et capable de diminuer les conséquences d’une colite chimique induite chez la souris. Nous avons appelé cette protéine MAM pour Molécule Anti-inflammatoire du Microbiote.
Ce projet de recherche a pour objectifs de valider un dosage de la protéine MAM fécale et la mise en évidence de corrélation inverse entre le taux de MAM fécale et l’activité de la MC. Pour ce faire, nous établirons un protocole permettant de doser MAM dans les selles à l’aide de la spectrométrie de masse. Ces dosages seront répétés et corrélés sur des échantillons de patients atteints de maladie de Crohn actives ou en rémission issus de la cohorte SUIVITHEQUE et de témoins sains. Une autre approche par dosage du génome bactérien de F. prau et MAM par PCR quantitative des mêmes échantillons sera réalisée.
Nous espérons démontrer, au cours de ce travail exploratoire, que la présence de la protéine MAM fécale est le témoin d’une muqueuse intestinale non-inflammatoire au cours de la MC. Le cas échéant, ces résultats ouvriront la voie à l’utilisation d’un nouveau biomarqueur de l’inflammation, issu de l’écosystème intestinal et facilement accessible.
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